Aunque la protección de ríos es uno de los temas de más urgencia en términos de conservación del ecosistema, los proyectos para la construcción de hidroeléctricas en los ríos Putumayo y Caquetá llevaron al investigador Javier Maldonado-Ocampo, ecólogo  profesor del departamento de Biología de la  Universidad Javeriana, a poner su lupa sobre el impacto de las represas en esta región. Junto a un grupo de investigadores, Maldonado estudió ocho de los ríos más importantes de la cuenca amazónica y pudo determinar que la inserción de hidroeléctricas alteran el hábitat de las especies de peces, crean barreras para su movimiento, reducen los servicios ecosistémicos y rompe la conectividad de la biodiversidad entre los Andes y el Amazonas, ocasionando que el flujo del río no sea natural.